1961年伊始，國內人事相對穩定；雷震案餘波蕩漾，雖有「非常上訴」之請，一切皆在掌控之中；惟在外交與國際地位上面臨巨大挑戰。美國總統甘迺迪（John F. Kennedy）入主白宮，華府當局有意改變對華政策，過去十年來支持臺北代表全中國的堅定立場逐步鬆動。面對美國政府可能著手改變對華政策，蔣中正開始認真思考推動軍事反攻大陸的具體措施。
1961年，蔣中正以推動軍事反攻大陸的動員與準備，回應外交與國際地位上面臨的巨大挑戰。在處理聯合國中國代表權案、外蒙古加入聯合國爭議等問題方面，心力交瘁。二度出任行政院院長的陳誠，在軍事反攻的軍費籌措方面，被質疑配合度不高，8月初的訪美之行，沒有突出表現，而10月中旬外蒙入聯問題決斷之際，卻因過勞引發肝疾，入院檢查、出院休養，甚至考慮請辭。反觀行政院政務委員蔣經國透過與中央情報局克來因（Ray S. Cline）的非正式管道，在3月至4月間處理滇緬國軍撤退、10月間處理外蒙入聯，關鍵時刻屢屢發揮關鍵性作用。在「總統老了怎麼辦」的疑問聲中，接班人的天平似乎又更偏向蔣經國了。
